选择任何你喜欢的值,默认值对大多数可视化计算来说是可行的。 这时,你的屏幕应如下图:
Figure 10.4. Gemstone APBS/Physics窗口
10.3.4. File I/O
下面,一直中间部分的 File I/O 标签。
你可以不必该这些设置,除非你想观察其它的性质。 这时,你的屏幕应如下所示:
Figure 10.5. Gemstone APBS/File I/O 窗口
10.3.5.运行计算
最后,返回到Calculation 标签下,选择 \。一会儿后,结果将出现在中间部分的输出标签下。计算结束时,你将看到:
Figure 10.6. Gemstone APBS/Calculation 屏幕 (计算结束)
特别地,你可以选择是否保存计算得到的势能文件。 10.3.6.其它计算
几乎所有本教程中的例子都可以通过Gemstone进行。更进一步,可以上传输入文件 并使用Gemstone作为进入其它研究机构网络服务的入口。 Chapter 11. 更多例子...
除了这里介绍的相对简单的应用之外, APBS 软件包(http://apbs.sf.net) 中含有大量其它的例子,包括电离能,蛋白质之间相互作用,并行计算等。 Chapter 12. 所有这些都没有回答我的问题...
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