① 放射性核素标记：用放射性同位素标记探针，检测标记信号，采用放射性自显影法。
② 荧光染料标记：用荧光染料物质（如溴乙锭等）标记探针，检测标记信号：能直接看到荧光 或采用特殊仪器收集荧光信号信息（如基因芯片用激光共聚集扫描收集荧光信号）。
③ 生物素标记探针：用生物素标记探针。检测标记信号：生物素分子上连接有特定的酶，加入相应底物后，通过特定酶催化反应过程，产生具有一定有色的物质。
3、什么是Southern印迹？有何应用？简述Southern blotting 的基本过程原理？
答：DNA印迹（DNA blotting）也称southern blotting,是 E.Southern 最先发明使用于检测DNA，顾称之。
其具体过程原理是：
(1) 将待测DNA用限制性核酸内切酶酶切水解得到大小不同的DNA片段。
(2) 将这些片段进行琼脂糖凝胶电泳，大小不同DNA片段停留在凝胶板上的不同位置形成不同的区带。
(3) 将含不同DNA片段的凝胶板放到DNA变性溶液（如0.5mol/L NaOH等）中进行变性处理，使双DNA成为单链DNA
(4) 将凝胶板上的变性DNA转移到硝酸纤维膜（NC膜 ，Nitrocellulose）上：用多量吸水纸吸附的毛细管作用，使凝胶板上DNA转移至NC膜上，由于NC膜具有很强的吸附DNA的作用，一旦胶板上DNA转移到NC膜上时，就能牢固的吸附在膜上，并保持原来位置不发生变化。
(5) 将转移后的NC膜经80℃真空加热或紫外交联仪处理，DNA就能非常牢固的固定在NC膜上，便于进行杂交。
(6) 杂交反应：将标记的探针与NC膜进行杂交，68℃杂交12小时。
(7)杂交信息监测：放射自显影或荧光信号监测确定有无杂交体、杂交体的位置及强弱。
应用：根据探针的碱基顺序确定目的基因的碱基顺序，对相关基因进行定性分析，还能进行定量析，以及对重组质粒进行分析等。
4、什么是Northern印迹？有何应用？Northern印迹与Southern印迹有何异同？
答：RNA印迹（RNA blotting）也称Northern Blotting，其基本过程及原理与Southern blotting 相同，只是监测对象由 DNA换成 RNA。由于被检测RNA分子较小，常无需限制性内切酶来酶切。电泳RNA转移至NC膜上以及杂交信息的检测，都与Southern blotting 相同。由于RNA极不稳定，易受RNA酶降解，因此实验过程中要加入RNA酶 抑制剂DEPC(焦磷酸二乙酯，diethlpyrocarbonate)
应用:主要用于RNA定量分析
(1) 检测组织细胞中某一已知的特异 mRNA的表达水平
(2) 比较不同组织细胞中同一基因（ mRNA ）的表达情况
5、什么是Western印迹？有何应用？Western印迹的基本过程原理是什么？ 答：蛋白质印迹常称为Western blotting（与Southern blotting, Northern blotting 相对应）。由于检测蛋白质不是用探针，而是用该蛋白质特异的相应抗
