动物育种学实验指导 - 图文(4)

2025-09-16

再如,11号公猪的横式系谱为:

图 10 11号公猪的横式系谱

改画成箭头式系谱:

图 11 11号公猪的箭头式系谱

这时,为了方便。可以将公式(1)简化成以下形式:

1Fx??[()N(1?FA)] (3)

2式中的N,是包括从父亲到共同祖先再到母亲这条通径链上的所有个体数,即相当于公式(1)中的n1?n2?1,其他符号均同公式(1)。

如果共同祖先不是近交所生,此时FA=0,公式还可进一步简化为:

1Fx??()N (4)

2从11号公猪的系谱中可以看到,其父母有20号和60号这两个共同祖先。先看20号,通过它连接11号的父母有一条通径,即100←20→219。而20号本身又是半同胞交配的后代,其近交系数:

15

1F20?()3?0.125

2再看另一个共同祖先60号,通过60号连接11号的父母通径有三条: 100←38←27←60→45→219, 100←20←92←60→45→219, 100←38←27←60→92→20→219。 按公式(3)计算11号的近交系数:

1111F11?[()3(1?0.125)?()6?()6?()7]

2222 =[0.140625+2×0.015625+0.0078125] =0.1797=17.97%

1.4 亲缘系数的估算

近交系数Fx的大小,取决于双亲间的亲缘程度,而亲缘程度的度量,则需要用亲缘系数RSD来表示。两者的区别在于,Fx是说明x这个个体本身,是由什么程度的近交产生的;而RSD则是说明S与D这两个个体间的遗传相关程度。

亲缘关系有两种。一种是直系亲属,即祖先和后代。另一种是旁系亲属,即那些既不是祖先又不是后代的亲属。

1.4.1 旁系亲属间的亲缘系数计算公式

RSD1N[(?2)(1?FA)] (5) ?(1?FS)(1?FD)RSD:代表个体S和D间的亲缘系数;

N:代表个体S和D分别到共同祖先的代数之和,即n1+n2; FS:代表个体S的近交系数; FD:代表个体D的近交系数; FA:代表共同祖先的近交系数。

如果个体S、D和A都不是近交个体,则公式可简化为;

1RSD??[()N] (6)

2例如计算全同胞X与Y的亲缘系数,其箭头式系谱为:

图 12 全同胞间的箭头式系谱

X到Y的通路有: X←A→Y X←B→Y

16

RXY?1??1????????0.5?50% ?2??2?221.4.2 直系亲属间的亲缘系数

在品系繁育中,需要计算个体与系祖间的亲缘系数,基本原理与计算旁系亲缘系数一样。其公式是:

RXA?1??????2?N1?FA (7) 1?FX式中N是由X到A的代数。若祖先A与个体X都不是近交个体,则公式可简化成:

RXA?1????? (8)

?2?N例如计算X与祖先S的亲缘系数,系谱如下:

图 13 X与祖先S的横式系谱

改成箭头式系谱:

图 14 X与祖先S的箭头式系谱

先求出X的近交系数:通过共同祖先S连接X的父母的通路有2条:S←S→D,S←S→I→D。所以

?1??1?FX???????0.375?37.5%

?2??2?FS=0

连接X与S的通路有3条:X←S, X←D←S,X←D←I←S;N值分别为1、2、3,代入公式(7):

RXS=[

7112131?00.7272=0.7461=74.61% =?()?()]2221?0.375823如果把近交系数与亲缘系数从公式上加以比较,就可以看出,个体的近交系数Fx,实际上等于其双亲的亲缘系数RSD乘上

(1?FS)(1?FD)217

。若双亲均非近交个体,即FS=FD=0,则

个体的近交系数,等于其双亲的亲缘系数的

11,即Fx?RSD,或RSD=2Fx。 221.4 畜群近交程度的估算

当需要估算一个畜群的平均近交程度时,可根据具体情况选用下列方法: (1) 当畜群较小时 可先求出每个个体的近交系数,再计算其平均值。

(2) 当畜群很大时 可随机抽取一定数量的家畜,逐个计算近交系数。然后用样本平均数代表畜群平均近交系数。

(3) 将畜群中的个体按近交程度分类 先求出每一类的近交系数,再以其加权平均数来代表畜群的平均近交系数。

(4) 对于长期不从外面引进种畜的闭锁畜群 平均近交系数可用下面的近似公式来进行估算:

?F?11 (9) ?8NS8NDΔF:代表畜群平均近交系数的每代“增量”; NS:代表每代参加配种的公畜数; ND:代表每代参加配种的母畜数。

畜群中的母畜数,一般数量较大,当母畜数在12头以上时,可略去此时的公式可简化为:

?F?1 (10) 8NS1这一部分不计。8ND例如有一闭锁畜群,常年使用两头公畜配种,代入公式得:

1?F??0.0625?6.25%

8?2经此估算,说明该畜群每代的近交系数增量为6.25%。

二、实验目的

1. 熟悉家畜系谱的类型,掌握家畜系谱中横式系谱和箭头式系谱的绘制以及二者的相互转换。

2. 熟悉通径系数的概念,掌握通径链追溯的原则及其在家畜箭头式系谱分析和中的应用。

3. 掌握评定家畜亲缘程度的基本方法:通过罗马数字表示和近交系数计算法。 4. 掌握旁系亲属间以及直系亲属间亲缘系数的估算方法。

5. 熟悉在不同情况下,通过计算平均近交系数来估计畜群的近交程度。

三、实验内容

现有289号公羊的竖式系谱(直式系谱)如下:

289号 181 49 —

135 108 90 — — 18

Ⅰ(亲代) 108 Ⅱ(祖代) — Ⅲ(曾祖代) — 16 — 16

请进行下列一系列的分析和计算:

1. 先将289号公羊的竖式系谱改制成横式系谱,然后再绘制其箭头式系谱,并分析指出其父母的共同祖先。

2. 通过罗马数字表示289号公羊共同祖先在系谱中所处的位置(代数),大致估计其近交程度;确定289号公羊是否为近交后代,并估算其近交系数。

3. 分析289号公羊的父母之间是旁系亲属还是直系亲属关系,计算其亲缘系数;确定289号公羊与16号羊之间是旁系亲属还是直系亲属关系,计算其亲缘系数。

4. 假设289号公羊所在的群体为一闭锁群,其中母羊的数量为24头,常年使用5头公羊配种,请估算该羊群每代的近交系数增量。

四、实验要求

1. 要求学生独立完成实验内容,并记录数据;写出完整的实验报告,有结果分析与相关问题的讨论。

2. 通过对每一实验步骤的完成,要求掌握相关内容的基础知识和分析计算方法。

3. 要求学生在掌握综合多个学科的整套分析方法的同时,启发学生的创造性思维,激发他们去改进一些分析计算过程的细节,允许用不同的分析计算方法;灌输科研的理念,培养提出和分析问题的能力。

五、实验步骤与流程

图 15 实验分析步骤

六、思考题

1. 系谱的构建以及不同类型的系谱对于动物的育种有何帮助? 2. 通径链的分析如何体现在本综合实验当中?

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3. 近交系数和亲缘系数的本质区别是什么?如何用动物细胞遗传和分子遗传学知识解释?

4. 畜群近交程度估计的依据是什么?

七、选用教材及主要参考书:

1. 家畜育种学. 张沅主编(面向21世纪课程教材). 北京:中国农业出版社,2001 2. 动物遗传学. 李宁主编(面向21世纪课程教材, 第二版). 北京:中国农业出版社,2003 3. 家畜育种学. 内蒙古农牧学院主编(全国统编教, 材第二版). 北京:农业出版社,1989 4. 动物遗传学. 北京农业大学主编(全国统编教). 北京:中国农业出版社,1999

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