酶的化学本质除了具有催化活性的RNA之外几乎都是蛋白质。但是，不能说所有的蛋白质都是酶，只是具有催化作用的蛋白质，才称为酶。
证明酶的化学本质是蛋白质的证据有以下几条。
（1）酶经酸碱水解后的最终产物是氨基酸，酶能被蛋白酶水解而失活。
（2）酶是具有空间结构的生物大分子，凡使蛋白质变性的因素都可使酶变性失活。
（3）酶是两性电解质，在不同pH值下呈现不同的离子状态，在电场中向某一电极泳动，各自具有特定的等电点。
（4）酶和蛋白质一样，具有不能通过半透膜等胶体性质。
（5）酶也有蛋白质所具有的化学呈色反应。
（6）与蛋白质的分子量相似，结构相似。
（7）在物理、化学因素作用下，也可变性沉淀。
（8）做元素分析，与蛋白质的元素含量相似，可以用氨基酸人工合成。
按照酶的化学组成可以将酶分为以下两类。
（1）单纯蛋白质酶 有些酶只是多肽链，除了氨基酸不含任何其他化学物质，也就是说有些酶是单纯蛋白质，如胰脏的核糖核酸酶、淀粉酶等。
（2）结合蛋白质酶 有些酶除了蛋白质外，还含有一些对热稳定的非蛋白质类小分子物质或金属离子，即由蛋白质部分和非蛋白质部分组成。结合蛋白质酶的蛋白质部分称为脱辅酶，非蛋白质部分称为辅因子。脱辅酶与辅因子结合后所形成的复合物称为“全酶”，即全酶=脱辅酶+辅因子。在酶催化时，一定要有脱辅酶和辅因子同时存在才起作用，二者各自单独存在时，均无催化作用。脱辅酶部分决定酶催化的专一性，辅酶（辅基）在酶催化中通常是起着电子、原子或某些化学基团的传递作用，大部分辅酶是维生素或维生素的衍生物。
4.酶的简单分类
国际酶学委员会（I. E. C)规定，按酶促反应的性质，可把酶分成六大类。
（1）氧化还原酶类 指催化氧化还原反应的酶类，又可分为氧化酶和脱氢酶两类，如乳酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶、细胞色素氧化酶、过氧化氢酶等。
（2）转移酶类 指催化化合物某些基团的转移，即将一种分子上的某一基团转移到另一种分子上的酶类，如转甲基酶、转氨酶、己糖激酶、磷酸化酶等。
