在认真总结农业产业化经营取得成效和经验的同时，我们也应清醒地认识存在的问题和不足。一是发展水平有待提高。龙头企业总体规模偏小，产品质量档次不高，地区间发展不平衡，特别是农产品加工水平低，与我国农业生产和消费大国的地位很不相称。二是发展机制有待完善。中介组织建设滞后，服务功能较弱。三是发展环境有待优化。体制不完善，政策不配套，特别是企业贷款比较困难，市场封锁现象依然存在，与建立完善的市场经济体制和中央支持“三农”的要求尚有一定差距。对这些问题，必须给予高度重视，采取有效措施，认真加以解决。
二、农业产业化经营面临的形势与发展思路
农业产业化是一件带全局性、方向性大事。目前，农业和农村经济发展正面临结构深刻调整、体制深刻转换、社会深刻变革的新的形势，我们要从全局和战略的高度充分认识发展农业产业化的重大意义，进一步强化发展意识，牢牢把握发展这个执政兴国的第一要务，紧紧抓住发展这个解决一切问题的关键，抓住新机遇，迎接新挑战，增强责任感和紧迫感，坚定不移地加快农业产业化发展。
（一）用科学发展观统领全局，更新发展理念
加快农业产业化发展，必须以科学发展观为统领，拓宽发展思路，创新发展理念。要坚持以人为本的理念，注重发挥产业化在促进农民增收、实现农民利益中的带动作用；坚持统筹协调理念，注重发挥产业化在推进战略性结构调整、实现农业和农村经济协调发展中的促进作用；坚持用现代工业理念谋划农业发展，注重发挥产业化在改造传统农业推进现代农业中的生力军作用；坚持运用商业化理念，注重发挥产业化在搞活农产品流通、发展农业精品名牌中的推动作用；坚持科技进步理念，注重发挥产业化在农业科技进步中的先导作用；坚持改革创新理念，注重发挥产业化在完善农业经营体制中的创新作用；坚持可持续发展理念，注重发挥产业化在发展资源节约型、环境友好型农业中的示范作用。
（二）围绕全面建设小康目标，加快发展进程
全面建设小康社会，重点难点在农村，关键在农民增收。农业产业化经营是今后农民增收的一大亮点。通过加快产业化发展，延长产业链条，发展精深加工，实现农产品加工增值，促进农业增效；通过加快发展，提高农民的组织化程度，降低生产和经营成本，增强农民抗御自然和市场风险的能力，促进农民增收；通过加快发展，促进农业生产向深度和广度进军，发展农村二三产业，推进城镇化、工业化，增加农民就业，繁荣农村经济。
（三）贯彻城乡统筹方略，抓住发展机遇
统筹城乡发展，从根本上打破城乡分割的二元结构，推进城乡一体化，构建以城带乡、以工促农、城乡互动、协调发展的体制和机制，有利于吸引各类市场主体进入农业领域，加入农业产业化经营行列，逐步实现规模经营；统筹城乡发展，彻底打通各类资源流入农村的渠道，改变目前农村资金、技术、人才匮乏的状态，有利于各种要素向农业产业化聚集，提升农业科技含量和装备水平，带动产业化经营质的飞跃；统筹城乡发展，工业反哺农业、城市支持农村，调整国民收入分配结构，有利于拓展国家支持农业的渠道和途径，增强产业化的发展能力。
（四）按照可持续发展要求，转变发展方式
要发展绿色经济，把基地建设与改善农业生态环境有机结合起来，加大农业污染防治力度，建设符合现代农业要求的农业产业化生产基地；发展集约经济，提高农业的有机构成，最大限度地提高资源利用率和土地产出率；发展生物质经济，推动农产品初加工后的副产品及其有机废弃物的系列开发，实现增值增效；发展循环经济，引导龙头企业努力实现低消耗、低排放、高效率，促进再生资源的循环利用和非再生资源的节约利用。
（五）适应市场竞争形势，提高发展能力
